MOLECULAR DOCKING SENYAWA GOLONGAN FLAVONOID BUAH TIN (Ficus carica L.) TERHADAP ENZIM HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE

Raysha Tryfhatya Nurhaidha; Musa’adah; Ayuni Adawiyah

Authors

Raysha Tryfhatya Nurhaidha UIN Sunan Gunung Djati Bandung, Indonesia
Musa’adah UIN Sunan Gunung Djati Bandung, Indonesia
Ayuni Adawiyah UIN Sunan Gunung Djati Bandung, Indonesia

Keywords:

antivirus, buah tin, flavonoid, HIV-1, molecular docking

Abstract

HIV (Human Immunodeficiency Virus) merupakan virus yang menyerang sel darah putih terutama sel CD4 (cluster of differentiation 4). Infeksi HIV menyebabkan penurunan kekebalan tubuh, sehingga penderita menjadi rentan terhadap berbagai infeksi oportunistik. Penggunaan obat antiretroviral saat ini dinilai belum sepenuhnya efektif, karena dapat menimbulkan resistensi virus terhadap obat. Kandungan senyawa aktif pada buah tin dilaporkan dapat berfungsi sebagai antivirus. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi senyawa metabolit dari buah tin, berupa senyawa golongan flavonoid yang berpotensi sebagai kandidat antivirus HIV. Penelitian ini dilakukan secara in silico melalui metode molecular docking, dengan menambatkan enam senyawa golongan flavonoid terhadap enzim HIV-1 reverse transcriptase. Penambatan menggunakan sofware PyRx dengan analisis berdasarkan nilai energi afinitas, konstanta inhibisi, dan interaksi molekuler. Hasil menunjukan bahwa keenam senyawa golongan flavonoid pada buah tin berpotensi sebagai inhibitor enzim HIV-1 reverse transcriptase. Dari keenam senyawa tersebut, luteolin merupakan kandidat senyawa paling potensial dalam menghambat enzim HIV-1 reverse transcriptase dengan niai energi afinitas dan konstanta inhibisi terendah (-8,8 kcal/mol dan 0,369 µM) serta memiliki interaksi yang kuat dengan 7 residu asam amino yang berikatan pada sisi aktif enzim HIV-1 reverse transcriptase.

Downloads

Download data is not yet available.

Author Biographies

Raysha Tryfhatya Nurhaidha, UIN Sunan Gunung Djati Bandung

Program Studi Biologi

Musa’adah, UIN Sunan Gunung Djati Bandung

Program Studi Biologi

Ayuni Adawiyah, UIN Sunan Gunung Djati Bandung

Program Studi Biologi

References

Ali, M. C., Nur, A. J., Khatun, M. S., Dash, R., Rahman, M. M., & Karim, M. M. (2020). Identification of potential SARS-CoV-2 main protease inhibitors from Ficus carica latex: an in-silico approach. Journal of Advanced Biotechnology and Experimental Therapeutics, 3(4), 57–57. https://doi.org/10.5455/JABET.2020.D157

Darmayanti, S., Khonsa, & Amelia, T. (2021). Antiviral activity and toxicity prediction of compounds contained in figs (Ficus carica L.) by in silico method. Indonesian Journal of Pharmaceutical Science and Technology, 8(1), 21–33.

Ekawasti, F., Sa’diah, S., Cahyaningsih, U., Luh, N., Dharmayanti, P. I., Subekti, T., Besar, B., & Veteriner, P. (2021). Molecular docking senyawa jahe merah dan kunyit pada dense granules protein-1 Toxoplasma gondii dengan metode in silico. Jurnal Veteriner, 22(4), 474–484.

Fajar, W., & Mulyani, T. (2020). Review artikel: etnofarmakologi tanaman tin (Ficus carica L.) (kajian tafsir ilmi tentang buah tin dalam Al-Qur’an). Jurnal Farmagazine, 7(1), 58–65. https://doi.org/10.47653/FARM.V7I1.156

Fayyaz, S., Islam, M., Ahmed, A., & Saeed, H. (2024). Evaluation of anti-hyperlipidemic activity of the seeds extracts of Ficus carica: in vitro and in silico approaches. Cell Biochemistry and Function, 42(7).

Hanif, A. U., Lukis, P. A., & Fadlan, A. (2020). Pengaruh minimisasi energi MMFF94 dengan marvinsketch dan open babel PyRx pada penambatan molekular turunan oksindola tersubstitusi. ALCHEMY: Journal of Chemistry, 8(2), 33–40. https://doi.org/10.18860/AL.V8I2.10481

Hokello, J., Tyagi, K., Owor, R. O., Sharma, A. L., Bhushan, A., Daniel, R., & Tyagi, M. (2024). New insights into HIV life cycle, Th1/Th2 shift during HIV infection and preferential virus infection of Th2 cells: implications of early HIV treatment initiation and care. Life, 14(1), 104.

Hsieh, S.-H., Yu, F.-H., Huang, K.-J., & Wang, C.-T. (2023). HIV-1 reverse transcriptase stability correlates with Gag cleavage efficiency: reverse transcriptase interaction implications for modulating protease activation. Journal of Virology, 97(9). https://doi.org/10.1128/jvi.00948-23

Masduki, A. I., Tilaqza, A., & Damayanti, D. S. (2024). Studi in silico: potensi senyawa aktif daun nimba (Azadirachta indica) sebagai antiviral terhadap SARS-COV-2. Jurnal Kedokteran Komunitas (Journal of Community Medicine), 12(1).

Nadia, R., Elvira, D., & Raveinal. (2022). HIV drug resistance mutations. Bioscientia Medicina: Journal of Biomedicine and Translational Research, 6(7), 2006–2013. https://doi.org/10.37275/BSM.V6I7.547

Ortiz, C. L. D., Completo, G. C., Nacario, R. C., & Nellas, R. B. (2019). Potential inhibitors of Galactofuranosyltransferase 2 (GlfT2): molecular docking, 3D-QSAR, and in silico ADMETox studies. Scientific Reports, 9(1), 1–28. https://doi.org/10.1038/s41598-019-52764-8

Prasetiyo, A., Martati, T., & Saputra, P. W. (2024). In silico study of bioactive compounds in herba sambiloto (Andrographis paniculata Burm. F. Nees) as HIV-1 reverse transcriptase inhibitor. Jurnal Jamu Indonesia, 9(2). https://doi.org/10.29244/jji.v9i2.300

Puspita, P. J., Liliyani, N. P. P., & Ambarsari, L. (2022). In silico analysis of active compounds of avocado fruit (Persea americana Mill.) as tyrosinase enzyme inhibitors. Current Biochemistry, 9(2), 73–87.

Sari, I. W., Junaidin, & Pratiwi, D. (2020). Studi molecular docking senyawa flavonoid herba kumis kucing (Orthosiphon stamineus B.) pada reseptor α-Glukosidase sebagai antidiabetes tipe 2. Jurnal Farmagazine, 7(2), 54–60.

Susanti, N. M. P., Saputra, D. P. D., Hendrayati, P. L., Parahyangan, I. P. D. N., & Amarawati, G. A. K. (2019). Molecular docking likopen sebagai antiosteoporosis secara in silico. Journal of Chemistry, 13(1), 29–33.

Thahara, C., Thahara, C. A., Rizarullah, R., Atika, R. A., & Wahab, A. (2022). Potensi pendekatan in silico sebagai penghambat aktivitas protein protease utama SARS-CoV-2 dari tiga senyawa tanaman obat jahe merah. Jurnal IPA & Pembelajaran IPA, 6(3), 207–218. https://doi.org/10.24815/jipi.v6i3.24914

Tumilaar, S. G., Siampa, J. P., & Tallei, T. E. (2021). Penambatan molekuler senyawa bioaktif dari ekstrak etanol daun pangi (Pangium edule) terhadap reseptor protease HIV-1. Jurnal Ilmiah Sains, 21(1), 6.

Zubair, M. S., Maulana, S., & Mukaddas, A. (2020). Penambatan molekuler dan simulasi dinamika molekuler senyawa dari genus nigella terhadap penghambatan aktivitas enzim protease HIV-1. Jurnal Farmasi Galenika (Galenika Journal of Pharmacy), 6(1), 132–140.